“毓英”自1859年创办到1952年人民政府接办,共93年历史,毕业学生约1200人(平均每年毕业约13人)。“毓英”的办学经费来源于卫理公会,主理校政者均为美藉女传教士。1927年“收回教育权”后,成立校董会,由校董会指派三人,组成三人小组主理校政,两年后改为董事会下的校长制。
抗战时期,“毓英”四度迁徙(迁往闽清、顺昌),二度易名(改为卫理公会所属的“三联中”)。
1952年7月,福州市人民政府接办“福州毓英女子初级中学”,并将“福州私立寻珍女子初级中学”和“福州私立邮电学校”的女生并入,成立“福州第二女子中学”,由初级中学改为完全中学,学校性质由私立转变为公立。
1956年,“福州第二女子中学”改名为“福州第十六中学”,男女学生兼收,结束了女校历史。